Index

_

__add__() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) __add_data() (dasf.utils.labels.DaskLabel method) __add_func() (dasf.utils.labels.DaskLabel method) __add_into_dag() (dasf.pipeline.Pipeline method) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline method) __add_item() (dasf.utils.labels.DaskLabel method) __agg_cluster_cpu (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering attribute) __args (dasf.utils.benchmark.MemoryBenchmark attribute) __array__() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetArray method) __array_ufunc__() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetArray method) __backend (dasf.utils.benchmark.MemoryBenchmark attribute) (dasf.utils.benchmark.TimeBenchmark attribute) __call__() (dasf.datasets.datasets.make_blobs method) (dasf.datasets.datasets.make_classification method) (dasf.datasets.datasets.make_regression method) (dasf.datasets.make_blobs method) (dasf.datasets.make_classification method) __check_op_input() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) __color (dasf.utils.labels.DaskLabel attribute) __copy_attrs_from_data() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) __current (dasf.utils.funcs.NotebookProgressBar attribute) __data_attrs (dasf.utils.labels.DaskLabel attribute) __dbscan_cpu (dasf.ml.cluster.DBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.dbscan.DBSCAN attribute) __debug (dasf.utils.benchmark.MemoryBenchmark attribute) __del__() (dasf.pipeline.executors.ray.RayPipelineExecutor method) (dasf.profile.plugins.ResourceMonitor method) __div__() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) __enter() (dasf.utils.labels.DaskLabel method) __enter__() (dasf.profile.profiler.EventDatabase method) (dasf.utils.benchmark.MemoryBenchmark method) (dasf.utils.benchmark.TimeBenchmark method) (dasf.utils.labels.DaskLabel method) __error (dasf.utils.funcs.NotebookProgressBar attribute) __execute() (dasf.pipeline.Pipeline method) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline method) __exit() (dasf.utils.labels.DaskLabel method) __exit__() (dasf.profile.profiler.EventDatabase method) (dasf.utils.benchmark.MemoryBenchmark method) (dasf.utils.benchmark.TimeBenchmark method) (dasf.utils.labels.DaskLabel method) __filename (dasf.datasets.download.DownloadGDrive attribute) (dasf.datasets.download.DownloadWget attribute) __fit_generic() (dasf.ml.dl.NeuralNetClassifier method) (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.NeuralNetClassifier method) __func_attrs (dasf.utils.labels.DaskLabel attribute) __generate_hashtable() (dasf.utils.labels.DaskLabel method) __getitem__() (dasf.datasets.base.Dataset method) (dasf.datasets.base.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.base.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.base.DatasetXarray method) (dasf.datasets.Dataset method) (dasf.datasets.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.DatasetXarray method) (dasf.ml.dl.lightning_fit.LazyDatasetComputer method) __gmm_cpu (dasf.ml.mixture.gmm.GaussianMixture attribute) __google_file_id (dasf.datasets.download.DownloadGDrive attribute) __handler (dasf.ml.dl.NeuralNetClassifier attribute) (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.NeuralNetClassifier attribute) __hash_attrs (dasf.utils.labels.DaskLabel attribute) __hdbscan_cpu (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) __inspect_element() (dasf.pipeline.Pipeline method) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline method) __iter__() (dasf.profile.MultiEventDatabase method) (dasf.profile.utils.MultiEventDatabase method) __kmeans_cpu (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute) __kmeans_mcpu (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute) __kwargs (dasf.utils.benchmark.MemoryBenchmark attribute) __label (dasf.utils.labels.DaskLabel attribute) __lazy_transform_generic() (dasf.transforms.base.MappedTransform method) (dasf.transforms.ComputeDaskData method) (dasf.transforms.MappedTransform method) (dasf.transforms.memory.ComputeDaskData method) (dasf.transforms.memory.PersistDaskData method) (dasf.transforms.PersistDaskData method) __len__() (dasf.datasets.base.Dataset method) (dasf.datasets.base.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.base.DatasetXarray method) (dasf.datasets.Dataset method) (dasf.datasets.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.DatasetXarray method) (dasf.ml.dl.lightning_fit.LazyDatasetComputer method) __linear_svc_cpu (dasf.ml.svm.LinearSVC attribute) (dasf.ml.svm.svm.LinearSVC attribute) __linear_svr_cpu (dasf.ml.svm.LinearSVR attribute) (dasf.ml.svm.svm.LinearSVR attribute) __lock (dasf.utils.funcs.NotebookProgressBar attribute) __mul__() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) __name() (dasf.utils.labels.DaskLabel method) __nn_cpu (dasf.ml.neighbors.NearestNeighbors attribute) (dasf.ml.neighbors.neighbors.NearestNeighbors attribute) __npy_header() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetArray method) __operator_check__() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetArray method) __output_file (dasf.utils.benchmark.MemoryBenchmark attribute) __pca_cpu (dasf.ml.decomposition.PCA attribute) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA attribute) __pca_mcpu (dasf.ml.decomposition.PCA attribute) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA attribute) __percent (dasf.feature_extraction.GetSubDataframe attribute) (dasf.feature_extraction.SampleDataframe attribute) (dasf.feature_extraction.transforms.GetSubCubeArray attribute) (dasf.feature_extraction.transforms.GetSubDataframe attribute) (dasf.feature_extraction.transforms.SampleDataframe attribute) __read_zarray() (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) __register_dataset() (dasf.pipeline.Pipeline method) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline method) __repr__() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) (dasf.profile.MultiEventDatabase method) (dasf.profile.profiler.EventProfiler method) (dasf.profile.profiler.FileDatabase method) (dasf.profile.utils.MultiEventDatabase method) __sc_cpu (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) __sc_mcpu (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) __set_dataset_cache_dir() (dasf.datasets.base.Dataset method) (dasf.datasets.Dataset method) __som_cpu (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) __som_mcpu (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) __start (dasf.utils.labels.DaskLabel attribute) __std_scaler_cpu (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler attribute) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler attribute) __std_scaler_dask (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler attribute) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler attribute) __stop (dasf.utils.labels.DaskLabel attribute) __str__() (dasf.ml.dl.models.devconvnet.MyAccuracy method) (dasf.profile.MultiEventDatabase method) (dasf.profile.profiler.EventProfiler method) (dasf.profile.profiler.FileDatabase method) (dasf.profile.utils.MultiEventDatabase method) __sub__() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) __svc_cpu (dasf.ml.svm.SVC attribute) (dasf.ml.svm.svm.SVC attribute) __svr_cpu (dasf.ml.svm.svm.SVR attribute) (dasf.ml.svm.SVR attribute) __total (dasf.utils.funcs.NotebookProgressBar attribute) __trainer (dasf.ml.dl.NeuralNetClassifier attribute) (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.NeuralNetClassifier attribute) __transform_generic() (dasf.feature_extraction.ConcatenateToArray method) (dasf.feature_extraction.transforms.ConcatenateToArray method) __url (dasf.datasets.download.DownloadWget attribute) __xgb_cpu (dasf.ml.xgboost.xgboost.XGBRegressor attribute) (dasf.ml.xgboost.XGBRegressor attribute) __xgb_mcpu (dasf.ml.xgboost.xgboost.XGBRegressor attribute) (dasf.ml.xgboost.XGBRegressor attribute) _accel (dasf.ml.dl.NeuralNetClassifier attribute) (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.NeuralNetClassifier attribute) _adjust_patches() (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase method) _apply_patches() (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase method) _backend (dasf.datasets.base.DatasetZarr attribute) (dasf.datasets.DatasetZarr attribute) _batch_size (dasf.ml.dl.NeuralNetClassifier attribute) (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.NeuralNetClassifier attribute) (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.TorchDataLoader attribute) _bins (dasf.feature_extraction.Histogram attribute) (dasf.feature_extraction.histogram.Histogram attribute) _build_dataframe() (dasf.transforms.ArraysToDataFrame method) (dasf.transforms.transforms.ArraysToDataFrame method) _callbacks (dasf.pipeline.Pipeline attribute) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline attribute) _chunks (dasf.datasets.base.Dataset attribute) (dasf.datasets.base.DatasetArray attribute) (dasf.datasets.base.DatasetDataFrame attribute) (dasf.datasets.base.DatasetHDF5 attribute) (dasf.datasets.base.DatasetLabeled attribute) (dasf.datasets.base.DatasetXarray attribute) (dasf.datasets.base.DatasetZarr attribute) (dasf.datasets.Dataset attribute) (dasf.datasets.DatasetArray attribute) (dasf.datasets.DatasetDataFrame attribute) (dasf.datasets.DatasetHDF5 attribute) (dasf.datasets.DatasetLabeled attribute) (dasf.datasets.DatasetXarray attribute) (dasf.datasets.DatasetZarr attribute) _combine_patches() (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase method) (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesVoting method) (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesWeightedAvg method) _convert_filename() (dasf.transforms.ArrayToHDF5 static method) (dasf.transforms.ArrayToZarr static method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToHDF5 static method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToZarr static method) (dasf.transforms.transforms.ZarrToArray static method) (dasf.transforms.ZarrToArray static method) _dag (dasf.pipeline.Pipeline attribute) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline attribute) _dag_g (dasf.pipeline.Pipeline attribute) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline attribute) _dag_table (dasf.pipeline.Pipeline attribute) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline attribute) _data (dasf.datasets.base.Dataset attribute) (dasf.datasets.Dataset attribute) _data_var (dasf.datasets.base.DatasetXarray attribute) (dasf.datasets.DatasetXarray attribute) _database (dasf.profile.analysis.TraceAnalyser attribute) (dasf.profile.TraceAnalyser attribute) _databases (dasf.profile.MultiEventDatabase attribute) (dasf.profile.utils.MultiEventDatabase attribute) _dataset_path (dasf.datasets.base.DatasetHDF5 attribute) (dasf.datasets.DatasetHDF5 attribute) _density (dasf.feature_extraction.Histogram attribute) (dasf.feature_extraction.histogram.Histogram attribute) _devices (dasf.ml.dl.NeuralNetClassifier attribute) (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.NeuralNetClassifier attribute) _download (dasf.datasets.base.Dataset attribute) (dasf.datasets.Dataset attribute) _executor (dasf.pipeline.Pipeline attribute) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline attribute) _extract_patches() (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase method) _fit() (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer method) (dasf.ml.dl.LightningTrainer method) _fit_cpu() (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering method) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering method) (dasf.ml.cluster.DBSCAN method) (dasf.ml.cluster.dbscan.DBSCAN method) (dasf.ml.cluster.HDBSCAN method) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN method) (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method) (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering method) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering method) (dasf.ml.decomposition.PCA method) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA method) (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer method) (dasf.ml.dl.LightningTrainer method) (dasf.ml.dl.NeuralNetClassifier method) (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.NeuralNetClassifier method) (dasf.ml.mixture.gmm.GaussianMixture method) (dasf.ml.neighbors.NearestNeighbors method) (dasf.ml.neighbors.neighbors.NearestNeighbors method) (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) (dasf.ml.svm.LinearSVC method) (dasf.ml.svm.LinearSVR method) (dasf.ml.svm.SVC method) (dasf.ml.svm.svm.LinearSVC method) (dasf.ml.svm.svm.LinearSVR method) (dasf.ml.svm.svm.SVC method) (dasf.ml.svm.svm.SVR method) (dasf.ml.svm.SVR method) (dasf.ml.xgboost.xgboost.XGBRegressor method) (dasf.ml.xgboost.XGBRegressor method) (dasf.transforms.base.Fit method) (dasf.transforms.Fit method) _fit_gpu() (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering method) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering method) (dasf.ml.cluster.DBSCAN method) (dasf.ml.cluster.dbscan.DBSCAN method) (dasf.ml.cluster.HDBSCAN method) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN method) (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method) (dasf.ml.decomposition.PCA method) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA method) (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer method) (dasf.ml.dl.LightningTrainer method) (dasf.ml.dl.NeuralNetClassifier method) (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.NeuralNetClassifier method) (dasf.ml.neighbors.NearestNeighbors method) (dasf.ml.neighbors.neighbors.NearestNeighbors method) (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) (dasf.ml.svm.LinearSVC method) (dasf.ml.svm.LinearSVR method) (dasf.ml.svm.SVC method) (dasf.ml.svm.svm.LinearSVC method) (dasf.ml.svm.svm.LinearSVR method) (dasf.ml.svm.svm.SVC method) (dasf.ml.svm.svm.SVR method) (dasf.ml.svm.SVR method) (dasf.ml.xgboost.xgboost.XGBRegressor method) (dasf.ml.xgboost.XGBRegressor method) (dasf.transforms.base.Fit method) (dasf.transforms.Fit method) _fit_predict_cpu() (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering method) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering method) (dasf.ml.cluster.DBSCAN method) (dasf.ml.cluster.dbscan.DBSCAN method) (dasf.ml.cluster.HDBSCAN method) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN method) (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method) (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering method) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering method) (dasf.ml.mixture.gmm.GaussianMixture method) (dasf.transforms.base.FitPredict method) (dasf.transforms.FitPredict method) _fit_predict_gpu() (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering method) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering method) (dasf.ml.cluster.DBSCAN method) (dasf.ml.cluster.dbscan.DBSCAN method) (dasf.ml.cluster.HDBSCAN method) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN method) (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method) (dasf.transforms.base.FitPredict method) (dasf.transforms.FitPredict method) _fit_transform_cpu() (dasf.ml.decomposition.PCA method) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA method) (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) (dasf.transforms.base.FitTransform method) (dasf.transforms.FitTransform method) _fit_transform_gpu() (dasf.ml.decomposition.PCA method) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA method) (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) (dasf.transforms.base.FitTransform method) (dasf.transforms.FitTransform method) _function (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase attribute) _get_covariance_cpu() (dasf.ml.decomposition.PCA method) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA method) _get_params_cpu() (dasf.ml.mixture.gmm.GaussianMixture method) (dasf.ml.neighbors.NearestNeighbors method) (dasf.ml.neighbors.neighbors.NearestNeighbors method) (dasf.ml.svm.SVC method) (dasf.ml.svm.svm.SVC method) (dasf.transforms.base.GetParams method) (dasf.transforms.GetParams method) _get_params_gpu() (dasf.transforms.base.GetParams method) (dasf.transforms.GetParams method) _get_precision_cpu() (dasf.ml.decomposition.PCA method) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA method) _hard_voting() (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesVoting method) _input_size (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase attribute) _internal_aggregate_array_negative() (dasf.transforms.operations.SliceArrayByPercentile method) _internal_aggregate_array_positive() (dasf.transforms.operations.SliceArrayByPercentile method) _internal_chunk_array_negative() (dasf.transforms.operations.SliceArrayByPercentile method) _internal_chunk_array_positive() (dasf.transforms.operations.SliceArrayByPercentile method) _inverse_transform_cpu() (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) _inverse_transform_gpu() (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) _lazy_fit_cpu() (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method) (dasf.ml.decomposition.PCA method) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA method) (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer method) (dasf.ml.dl.LightningTrainer method) (dasf.ml.dl.NeuralNetClassifier method) (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.NeuralNetClassifier method) (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) (dasf.ml.xgboost.xgboost.XGBRegressor method) (dasf.ml.xgboost.XGBRegressor method) (dasf.transforms.base.Fit method) (dasf.transforms.Fit method) _lazy_fit_generic() (dasf.ml.dl.NeuralNetClassifier method) (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.NeuralNetClassifier method) _lazy_fit_gpu() (dasf.ml.cluster.DBSCAN method) (dasf.ml.cluster.dbscan.DBSCAN method) (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method) (dasf.ml.decomposition.PCA method) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA method) (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer method) (dasf.ml.dl.LightningTrainer method) (dasf.ml.dl.NeuralNetClassifier method) (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.NeuralNetClassifier method) (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) (dasf.ml.xgboost.xgboost.XGBRegressor method) (dasf.ml.xgboost.XGBRegressor method) (dasf.transforms.base.Fit method) (dasf.transforms.Fit method) _lazy_fit_predict_cpu() (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method) (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering method) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering method) (dasf.transforms.base.FitPredict method) (dasf.transforms.FitPredict method)

_lazy_fit_predict_gpu() (dasf.ml.cluster.DBSCAN method) (dasf.ml.cluster.dbscan.DBSCAN method) (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method) (dasf.transforms.base.FitPredict method) (dasf.transforms.FitPredict method) _lazy_fit_transform_cpu() (dasf.ml.decomposition.PCA method) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA method) (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) (dasf.transforms.base.FitTransform method) (dasf.transforms.FitTransform method) _lazy_fit_transform_gpu() (dasf.ml.decomposition.PCA method) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA method) (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) (dasf.transforms.base.FitTransform method) (dasf.transforms.FitTransform method) _lazy_get_params_cpu() (dasf.transforms.base.GetParams method) (dasf.transforms.GetParams method) _lazy_get_params_gpu() (dasf.transforms.base.GetParams method) (dasf.transforms.GetParams method) _lazy_inverse_transform_cpu() (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) _lazy_inverse_transform_gpu() (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) _lazy_load() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.base.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.base.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) (dasf.ml.inference.loader.base.BaseLoader method) _lazy_load_cpu() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.base.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.base.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.base.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.base.DatasetParquet method) (dasf.datasets.base.DatasetXarray method) (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.DatasetParquet method) (dasf.datasets.DatasetXarray method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) (dasf.ml.inference.loader.base.BaseLoader method) _lazy_load_gpu() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.base.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.base.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.base.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.base.DatasetParquet method) (dasf.datasets.base.DatasetXarray method) (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.DatasetParquet method) (dasf.datasets.DatasetXarray method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) (dasf.ml.inference.loader.base.BaseLoader method) _lazy_make_blobs_cpu() (dasf.datasets.datasets.make_blobs method) (dasf.datasets.make_blobs method) _lazy_make_blobs_gpu() (dasf.datasets.datasets.make_blobs method) (dasf.datasets.make_blobs method) _lazy_make_classification_cpu() (dasf.datasets.datasets.make_classification method) (dasf.datasets.make_classification method) _lazy_make_classification_gpu() (dasf.datasets.datasets.make_classification method) (dasf.datasets.make_classification method) _lazy_make_regression_cpu() (dasf.datasets.datasets.make_regression method) _lazy_make_regression_gpu() (dasf.datasets.datasets.make_regression method) _lazy_partial_fit_cpu() (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) _lazy_partial_fit_gpu() (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) _lazy_predict2_cpu() (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) _lazy_predict2_gpu() (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) _lazy_predict_cpu() (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method) (dasf.ml.xgboost.xgboost.XGBRegressor method) (dasf.ml.xgboost.XGBRegressor method) (dasf.transforms.base.Predict method) (dasf.transforms.Predict method) _lazy_predict_gpu() (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method) (dasf.ml.xgboost.xgboost.XGBRegressor method) (dasf.ml.xgboost.XGBRegressor method) (dasf.transforms.base.Predict method) (dasf.transforms.Predict method) _lazy_quantization_error_cpu() (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method) _lazy_quantization_error_gpu() (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method) _lazy_set_params_cpu() (dasf.transforms.base.SetParams method) _lazy_set_params_gpu() (dasf.transforms.base.SetParams method) _lazy_transform() (dasf.transforms.ArraysToDataFrame method) (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase method) (dasf.transforms.transforms.ArraysToDataFrame method) _lazy_transform_cpu() (dasf.feature_extraction.Histogram method) (dasf.feature_extraction.histogram.Histogram method) (dasf.ml.decomposition.PCA method) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA method) (dasf.ml.model_selection.split.train_test_split method) (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) (dasf.transforms.ArraysToDataFrame method) (dasf.transforms.ArrayToHDF5 method) (dasf.transforms.ArrayToZarr method) (dasf.transforms.base.MappedTransform method) (dasf.transforms.base.ReductionTransform method) (dasf.transforms.base.Transform method) (dasf.transforms.ComputeDaskData method) (dasf.transforms.MappedTransform method) (dasf.transforms.memory.ComputeDaskData method) (dasf.transforms.memory.PersistDaskData method) (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase method) (dasf.transforms.operations.SliceArrayByPercentile method) (dasf.transforms.PersistDaskData method) (dasf.transforms.ReductionTransform method) (dasf.transforms.transforms.ArraysToDataFrame method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToHDF5 method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToZarr method) _lazy_transform_generic() (dasf.feature_extraction.Histogram method) (dasf.feature_extraction.histogram.Histogram method) (dasf.transforms.ArrayToHDF5 method) (dasf.transforms.ArrayToZarr method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToHDF5 method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToZarr method) _lazy_transform_generic_all() (dasf.transforms.ArrayToHDF5 method) (dasf.transforms.ArrayToZarr method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToHDF5 method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToZarr method) _lazy_transform_gpu() (dasf.feature_extraction.Histogram method) (dasf.feature_extraction.histogram.Histogram method) (dasf.ml.decomposition.PCA method) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA method) (dasf.ml.model_selection.split.train_test_split method) (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) (dasf.transforms.ArraysToDataFrame method) (dasf.transforms.ArrayToHDF5 method) (dasf.transforms.ArrayToZarr method) (dasf.transforms.base.MappedTransform method) (dasf.transforms.base.ReductionTransform method) (dasf.transforms.base.Transform method) (dasf.transforms.ComputeDaskData method) (dasf.transforms.MappedTransform method) (dasf.transforms.memory.ComputeDaskData method) (dasf.transforms.memory.PersistDaskData method) (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase method) (dasf.transforms.operations.SliceArrayByPercentile method) (dasf.transforms.PersistDaskData method) (dasf.transforms.ReductionTransform method) (dasf.transforms.transforms.ArraysToDataFrame method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToHDF5 method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToZarr method) _load() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.base.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.base.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) (dasf.ml.inference.loader.base.BaseLoader method) _load_cpu() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.base.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.base.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.base.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.base.DatasetParquet method) (dasf.datasets.base.DatasetXarray method) (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.DatasetParquet method) (dasf.datasets.DatasetXarray method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) (dasf.ml.inference.loader.base.BaseLoader method) _load_gpu() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.base.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.base.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.base.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.base.DatasetParquet method) (dasf.datasets.base.DatasetXarray method) (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.DatasetParquet method) (dasf.datasets.DatasetXarray method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) (dasf.ml.inference.loader.base.BaseLoader method) _load_meta() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.base.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.base.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.base.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.base.DatasetXarray method) (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.DatasetXarray method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) _logger (dasf.pipeline.Pipeline attribute) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline attribute) _make_blobs_cpu() (dasf.datasets.datasets.make_blobs method) (dasf.datasets.make_blobs method) _make_blobs_gpu() (dasf.datasets.datasets.make_blobs method) (dasf.datasets.make_blobs method) _make_classification_cpu() (dasf.datasets.datasets.make_classification method) (dasf.datasets.make_classification method) _make_classification_gpu() (dasf.datasets.datasets.make_classification method) (dasf.datasets.make_classification method) _make_regression_cpu() (dasf.datasets.datasets.make_regression method) _make_regression_gpu() (dasf.datasets.datasets.make_regression method) _master_port (dasf.ml.dl.clusters.dask.DaskClusterEnvironment attribute) (dasf.ml.dl.clusters.DaskClusterEnvironment attribute) _max_iter (dasf.ml.dl.NeuralNetClassifier attribute) (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.NeuralNetClassifier attribute) _metadata (dasf.datasets.base.Dataset attribute) (dasf.datasets.Dataset attribute) _model (dasf.ml.dl.NeuralNetClassifier attribute) (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.NeuralNetClassifier attribute) _name (dasf.datasets.base.Dataset attribute) (dasf.datasets.Dataset attribute) (dasf.pipeline.Pipeline attribute) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline attribute) _ngpus (dasf.ml.dl.NeuralNetClassifier attribute) (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.NeuralNetClassifier attribute) _normed (dasf.feature_extraction.Histogram attribute) (dasf.feature_extraction.histogram.Histogram attribute) _num_classes (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesVoting attribute) _offsets (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase attribute) _operation() (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase method) _operation_aggregate_cpu() (dasf.transforms.base.ReductionTransform method) (dasf.transforms.ReductionTransform method) _operation_aggregate_gpu() (dasf.transforms.base.ReductionTransform method) (dasf.transforms.ReductionTransform method) _operation_chunk_cpu() (dasf.transforms.base.ReductionTransform method) (dasf.transforms.ReductionTransform method) _operation_chunk_gpu() (dasf.transforms.base.ReductionTransform method) (dasf.transforms.ReductionTransform method) _operation_combine_cpu() (dasf.transforms.base.ReductionTransform method) (dasf.transforms.ReductionTransform method) _operation_combine_gpu() (dasf.transforms.base.ReductionTransform method) (dasf.transforms.ReductionTransform method) _overlap_config (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase attribute) _partial_fit_cpu() (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) _partial_fit_gpu() (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) _predict2_cpu() (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) _predict2_gpu() (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) _predict_cpu() (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method) (dasf.ml.mixture.gmm.GaussianMixture method) (dasf.ml.svm.LinearSVC method) (dasf.ml.svm.LinearSVR method) (dasf.ml.svm.SVC method) (dasf.ml.svm.svm.LinearSVC method) (dasf.ml.svm.svm.LinearSVR method) (dasf.ml.svm.svm.SVC method) (dasf.ml.svm.svm.SVR method) (dasf.ml.svm.SVR method) (dasf.ml.xgboost.xgboost.XGBRegressor method) (dasf.ml.xgboost.XGBRegressor method) (dasf.transforms.base.Predict method) (dasf.transforms.Predict method) _predict_gpu() (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method) (dasf.ml.svm.LinearSVC method) (dasf.ml.svm.LinearSVR method) (dasf.ml.svm.SVC method) (dasf.ml.svm.svm.LinearSVC method) (dasf.ml.svm.svm.LinearSVR method) (dasf.ml.svm.svm.SVC method) (dasf.ml.svm.svm.SVR method) (dasf.ml.svm.SVR method) (dasf.ml.xgboost.xgboost.XGBRegressor method) (dasf.ml.xgboost.XGBRegressor method) (dasf.transforms.base.Predict method) (dasf.transforms.Predict method) _quantization_error_cpu() (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method) _quantization_error_gpu() (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method) _range (dasf.feature_extraction.Histogram attribute) (dasf.feature_extraction.histogram.Histogram attribute) _reconstruct_patches() (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase method) _record() (dasf.profile.profiler.EventProfiler method) _root (dasf.datasets.base.Dataset attribute) (dasf.datasets.Dataset attribute) _root_file (dasf.datasets.base.DatasetArray attribute) (dasf.datasets.base.DatasetDataFrame attribute) (dasf.datasets.base.DatasetHDF5 attribute) (dasf.datasets.base.DatasetXarray attribute) (dasf.datasets.base.DatasetZarr attribute) (dasf.datasets.DatasetArray attribute) (dasf.datasets.DatasetDataFrame attribute) (dasf.datasets.DatasetHDF5 attribute) (dasf.datasets.DatasetXarray attribute) (dasf.datasets.DatasetZarr attribute) _run_gpu (dasf.transforms.base.TargeteredTransform attribute) (dasf.transforms.TargeteredTransform attribute) _run_local (dasf.transforms.base.TargeteredTransform attribute) (dasf.transforms.TargeteredTransform attribute) _set_params_cpu() (dasf.ml.mixture.gmm.GaussianMixture method) (dasf.ml.neighbors.NearestNeighbors method) (dasf.ml.neighbors.neighbors.NearestNeighbors method) (dasf.ml.svm.SVC method) (dasf.ml.svm.svm.SVC method) (dasf.transforms.base.SetParams method) _set_params_gpu() (dasf.transforms.base.SetParams method) _soft_voting() (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesVoting method) _strategy (dasf.ml.dl.NeuralNetClassifier attribute) (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.NeuralNetClassifier attribute) _tasks_map (dasf.pipeline.executors.dask.DaskTasksPipelineExecutor attribute) (dasf.pipeline.executors.DaskTasksPipelineExecutor attribute) _test (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.TorchDataLoader attribute) _train (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.TorchDataLoader attribute) _transform() (dasf.transforms.ArraysToDataFrame method) (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase method) (dasf.transforms.transforms.ArraysToDataFrame method) _transform_cpu() (dasf.feature_extraction.ConcatenateToArray method) (dasf.feature_extraction.Histogram method) (dasf.feature_extraction.histogram.Histogram method) (dasf.feature_extraction.transforms.ConcatenateToArray method) (dasf.ml.decomposition.PCA method) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA method) (dasf.ml.model_selection.split.train_test_split method) (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) (dasf.transforms.ArraysToDataFrame method) (dasf.transforms.ArrayToHDF5 method) (dasf.transforms.ArrayToZarr method) (dasf.transforms.base.MappedTransform method) (dasf.transforms.base.ReductionTransform method) (dasf.transforms.base.Transform method) (dasf.transforms.ComputeDaskData method) (dasf.transforms.MappedTransform method) (dasf.transforms.memory.ComputeDaskData method) (dasf.transforms.memory.PersistDaskData method) (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase method) (dasf.transforms.operations.SliceArrayByPercentile method) (dasf.transforms.PersistDaskData method) (dasf.transforms.ReductionTransform method) (dasf.transforms.transforms.ArraysToDataFrame method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToHDF5 method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToZarr method) _transform_generic() (dasf.feature_extraction.Histogram method) (dasf.feature_extraction.histogram.Histogram method) (dasf.transforms.ArrayToHDF5 method) (dasf.transforms.ArrayToZarr method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToHDF5 method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToZarr method) _transform_generic_all() (dasf.transforms.ArrayToHDF5 method) (dasf.transforms.ArrayToZarr method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToHDF5 method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToZarr method) _transform_gpu() (dasf.feature_extraction.ConcatenateToArray method) (dasf.feature_extraction.Histogram method) (dasf.feature_extraction.histogram.Histogram method) (dasf.feature_extraction.transforms.ConcatenateToArray method) (dasf.ml.decomposition.PCA method) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA method) (dasf.ml.model_selection.split.train_test_split method) (dasf.ml.preprocessing.StandardScaler method) (dasf.ml.preprocessing.standardscaler.StandardScaler method) (dasf.transforms.ArraysToDataFrame method) (dasf.transforms.ArrayToHDF5 method) (dasf.transforms.ArrayToZarr method) (dasf.transforms.base.MappedTransform method) (dasf.transforms.base.ReductionTransform method) (dasf.transforms.base.Transform method) (dasf.transforms.ComputeDaskData method) (dasf.transforms.MappedTransform method) (dasf.transforms.memory.ComputeDaskData method) (dasf.transforms.memory.PersistDaskData method) (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase method) (dasf.transforms.operations.SliceArrayByPercentile method) (dasf.transforms.PersistDaskData method) (dasf.transforms.ReductionTransform method) (dasf.transforms.transforms.ArraysToDataFrame method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToHDF5 method) (dasf.transforms.transforms.ArrayToZarr method) _val (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.TorchDataLoader attribute) _verbose (dasf.pipeline.Pipeline attribute) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline attribute) _voting (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesVoting attribute) _weight_function (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase attribute) _weights (dasf.feature_extraction.Histogram attribute) (dasf.feature_extraction.histogram.Histogram attribute)

A

accelerator (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer attribute) (dasf.ml.dl.LightningTrainer attribute) activation_distance (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) add() (dasf.pipeline.Pipeline method) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline method) address (dasf.pipeline.executors.dask.DaskPipelineExecutor attribute) (dasf.pipeline.executors.DaskPipelineExecutor attribute) (dasf.pipeline.executors.ray.RayPipelineExecutor attribute) affinity (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) AgglomerativeClustering (class in dasf.ml.cluster) (class in dasf.ml.cluster.agglomerative) algorithm (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute) allow_single_cluster (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) alpha (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) ApplyPatchesBase (class in dasf.transforms.operations)

ApplyPatchesVoting (class in dasf.transforms.operations) ApplyPatchesWeightedAvg (class in dasf.transforms.operations) approx_min_span_tree (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) args (dasf.profile.profiler.CompleteEvent attribute) (dasf.profile.profiler.DurationBeginEvent attribute) (dasf.profile.profiler.DurationEndEvent attribute) (dasf.profile.profiler.InstantEvent attribute) Array (in module dasf.utils.types) ArrayCPU (in module dasf.utils.types) ArrayGPU (in module dasf.utils.types) ArraysToDataFrame (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.transforms) ArrayToHDF5 (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.transforms) ArrayToZarr (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.transforms) assign_labels (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) ASYNC_BEGIN (dasf.profile.profiler.EventPhases attribute) ASYNC_END (dasf.profile.profiler.EventPhases attribute) ASYNC_INSTANT (dasf.profile.profiler.EventPhases attribute)

B

backend (dasf.pipeline.executors.LocalExecutor attribute) (dasf.pipeline.executors.wrapper.LocalExecutor attribute) bar (dasf.utils.funcs.NotebookProgressBar attribute) BaseLoader (class in dasf.ml.inference.loader.base) batch_size (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer attribute) (dasf.ml.dl.LightningTrainer attribute)

block_chunk_reduce() (in module dasf.utils.funcs) blockwise (dasf.ml.model_selection.split.train_test_split attribute) boundary (dasf.transforms.base.MappedTransform attribute) (dasf.transforms.MappedTransform attribute) byte_size (dasf.profile.profiler.FileDatabase attribute)

C

calc_core_sample_indices (dasf.ml.cluster.DBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.dbscan.DBSCAN attribute) callback (dasf.profile.plugins.ResourceMonitor attribute) checkpoint (dasf.ml.inference.loader.torch.TorchLoader attribute) chunks (dasf.transforms.ArrayToHDF5 attribute) (dasf.transforms.ArrayToZarr attribute) (dasf.transforms.transforms.ArrayToHDF5 attribute) (dasf.transforms.transforms.ArrayToZarr attribute) (dasf.transforms.transforms.ZarrToArray attribute) (dasf.transforms.ZarrToArray attribute) chunksize (dasf.datasets.base.DatasetZarr property) (dasf.datasets.DatasetZarr property) class_names (dasf.ml.dl.models.devconvnet.NNModule attribute) client (dasf.pipeline.executors.dask.DaskPBSPipelineExecutor attribute) (dasf.pipeline.executors.DaskPBSPipelineExecutor attribute) clip (dasf.ml.dl.models.devconvnet.NNModule attribute) close() (dasf.pipeline.executors.dask.DaskPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.dask.DaskTasksPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.DaskPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.DaskTasksPipelineExecutor method) (dasf.profile.profiler.EventDatabase method) (dasf.profile.profiler.FileDatabase method) cluster_selection_method (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) ClusterClassifier (class in dasf.ml.cluster.classifier) coef0 (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) commit() (dasf.profile.profiler.EventDatabase method) (dasf.profile.profiler.EventProfiler method) (dasf.profile.profiler.FileDatabase method) commit_on_close (dasf.profile.profiler.FileDatabase attribute) commit_threshold (dasf.profile.profiler.FileDatabase attribute) compact_support (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) COMPLETE (dasf.profile.profiler.EventPhases attribute) CompleteEvent (class in dasf.profile.profiler) compute() (dasf.ml.dl.models.devconvnet.MyAccuracy method) compute_distances (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering attribute) compute_full_tree (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering attribute) ComputeDaskData (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.memory) ConcatenateToArray (class in dasf.feature_extraction) (class in dasf.feature_extraction.transforms) configure_optimizers() (dasf.ml.dl.models.devconvnet.NNModule method) connectivity (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) conv_block1 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) conv_block2 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute)

conv_block3 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) conv_block4 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) conv_block5 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) conv_block6 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) conv_block7 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) convert_mixed_types (dasf.ml.model_selection.split.train_test_split attribute) copy_x (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute) core_dist_n_jobs (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) COUNTER (dasf.profile.profiler.EventPhases attribute) create_annotated_task_graph() (dasf.profile.analysis.TraceAnalyser method) (dasf.profile.TraceAnalyser method) creates_children() (dasf.ml.dl.clusters.dask.DaskClusterEnvironment method) (dasf.ml.dl.clusters.DaskClusterEnvironment method) creates_processes_externally (dasf.ml.dl.clusters.dask.DaskClusterEnvironment property) (dasf.ml.dl.clusters.DaskClusterEnvironment property) cross_entropy_loss() (dasf.ml.dl.models.devconvnet.NNModule method)

D

dasf module dasf.datasets module dasf.datasets.base module dasf.datasets.datasets module dasf.datasets.download module dasf.debug module dasf.debug.debug module dasf.feature_extraction module dasf.feature_extraction.histogram module dasf.feature_extraction.transforms module dasf.ml module dasf.ml.cluster module dasf.ml.cluster.agglomerative module dasf.ml.cluster.classifier module dasf.ml.cluster.dbscan module dasf.ml.cluster.hdbscan module dasf.ml.cluster.kmeans module dasf.ml.cluster.som module dasf.ml.cluster.spectral module dasf.ml.decomposition module dasf.ml.decomposition.pca module dasf.ml.dl module dasf.ml.dl.clusters module dasf.ml.dl.clusters.dask module dasf.ml.dl.lightning_fit module dasf.ml.dl.models module dasf.ml.dl.models.devconvnet module dasf.ml.dl.pytorch_lightning module dasf.ml.inference module dasf.ml.inference.loader module dasf.ml.inference.loader.base module dasf.ml.inference.loader.torch module dasf.ml.mixture.classifier module dasf.ml.mixture.gmm module dasf.ml.model_selection module dasf.ml.model_selection.split module dasf.ml.neighbors module dasf.ml.neighbors.neighbors module dasf.ml.preprocessing module dasf.ml.preprocessing.standardscaler module dasf.ml.svm module dasf.ml.svm.svm module dasf.ml.xgboost module dasf.ml.xgboost.xgboost module dasf.pipeline module dasf.pipeline.executors module dasf.pipeline.executors.base module dasf.pipeline.executors.dask module dasf.pipeline.executors.ray module dasf.pipeline.executors.wrapper module dasf.pipeline.pipeline module dasf.pipeline.types module dasf.profile module dasf.profile.analysis module dasf.profile.plugins module dasf.profile.profiler module dasf.profile.utils module dasf.transforms module dasf.transforms.base module dasf.transforms.memory module dasf.transforms.operations module dasf.transforms.transforms module dasf.utils module dasf.utils.benchmark module dasf.utils.decorators module dasf.utils.funcs module

dasf.utils.labels module dasf.utils.logging module dasf.utils.types module DaskArray (in module dasf.utils.types) DaskClusterEnvironment (class in dasf.ml.dl.clusters) (class in dasf.ml.dl.clusters.dask) DaskDataFrame (in module dasf.utils.types) DaskDataFrameCPU (in module dasf.utils.types) DaskLabel (class in dasf.utils.labels) DaskPBSPipelineExecutor (class in dasf.pipeline.executors) (class in dasf.pipeline.executors.dask) DaskPipelineExecutor (class in dasf.pipeline.executors) (class in dasf.pipeline.executors.dask) DaskTasksPipelineExecutor (class in dasf.pipeline.executors) (class in dasf.pipeline.executors.dask) data (dasf.utils.funcs.NotebookProgressBar attribute) database (dasf.profile.plugins.ResourceMonitor attribute) database_file (dasf.profile.profiler.FileDatabase attribute) DataCPU (in module dasf.utils.types) DataDask (in module dasf.utils.types) DataFrame (in module dasf.utils.types) DataFrameCPU (in module dasf.utils.types) Dataset (class in dasf.datasets) (class in dasf.datasets.base) dataset (dasf.ml.dl.lightning_fit.LazyDatasetComputer attribute) dataset_path (dasf.transforms.ArrayToHDF5 attribute) (dasf.transforms.transforms.ArrayToHDF5 attribute) DatasetArray (class in dasf.datasets) (class in dasf.datasets.base) DatasetDataFrame (class in dasf.datasets) (class in dasf.datasets.base) DatasetHDF5 (class in dasf.datasets) (class in dasf.datasets.base) DatasetLabeled (class in dasf.datasets) (class in dasf.datasets.base) DatasetParquet (class in dasf.datasets) (class in dasf.datasets.base) DatasetXarray (class in dasf.datasets) (class in dasf.datasets.base) DatasetZarr (class in dasf.datasets) (class in dasf.datasets.base) DBSCAN (class in dasf.ml.cluster) (class in dasf.ml.cluster.dbscan) Debug (class in dasf.debug) (class in dasf.debug.debug) decay_function (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) deconv_block10 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) deconv_block12 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) deconv_block14 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) deconv_block16 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) deconv_block18 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) deconv_block8 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) default_database (dasf.profile.profiler.EventProfiler attribute) default_database_kwargs (dasf.profile.profiler.EventProfiler attribute) degree (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) depth (dasf.transforms.base.MappedTransform attribute) (dasf.transforms.MappedTransform attribute) detect() (dasf.ml.dl.clusters.dask.DaskClusterEnvironment method) (dasf.ml.dl.clusters.DaskClusterEnvironment method) device (dasf.ml.inference.loader.torch.TorchLoader attribute) devices (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer attribute) (dasf.ml.dl.LightningTrainer attribute) display() (dasf.debug.Debug method) (dasf.debug.debug.Debug method) (dasf.debug.debug.VisualizeDaskData method) (dasf.debug.VisualizeDaskData method) distance_threshold (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering attribute) download() (dasf.datasets.base.Dataset method) (dasf.datasets.base.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.Dataset method) (dasf.datasets.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.download.DownloadGDrive method) (dasf.datasets.download.DownloadWget method) download_file() (in module dasf.utils.funcs) download_file_from_gdrive() (in module dasf.utils.funcs) DownloadGDrive (class in dasf.datasets.download) DownloadWget (class in dasf.datasets.download) drop_axis (dasf.transforms.base.MappedTransform attribute) (dasf.transforms.MappedTransform attribute) dtype (dasf.ml.inference.loader.torch.TorchLoader attribute) duration (dasf.profile.profiler.CompleteEvent attribute) DURATION_BEGIN (dasf.profile.profiler.EventPhases attribute) DURATION_END (dasf.profile.profiler.EventPhases attribute) DurationBeginEvent (class in dasf.profile.profiler) DurationEndEvent (class in dasf.profile.profiler)

E

eigen_solver (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) eigen_tol (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) eps (dasf.ml.cluster.DBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.dbscan.DBSCAN attribute) event_classes (in module dasf.profile.profiler) EventDatabase (class in dasf.profile.profiler) EventPhases (class in dasf.profile.profiler) EventProfiler (class in dasf.profile.profiler) EventTypes (in module dasf.profile.profiler) execute() (dasf.pipeline.executors.base.Executor method) (dasf.pipeline.executors.dask.DaskPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.dask.DaskTasksPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.DaskPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.DaskTasksPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.Executor method) (dasf.pipeline.executors.LocalExecutor method) (dasf.pipeline.executors.ray.RayPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.wrapper.LocalExecutor method)

execute_callbacks() (dasf.pipeline.Pipeline method) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline method) Executor (class in dasf.pipeline.executors) (class in dasf.pipeline.executors.base) executor_to_string() (in module dasf.utils.funcs) ExtractData (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.transforms)

F

fetch_args_from_dask() (in module dasf.utils.decorators) fetch_args_from_gpu() (in module dasf.utils.decorators) fetch_from_dask() (in module dasf.utils.decorators) fetch_from_gpu() (in module dasf.utils.decorators) FileDatabase (class in dasf.profile.profiler) filename (dasf.debug.debug.VisualizeDaskData attribute) (dasf.debug.VisualizeDaskData attribute) (dasf.transforms.ArrayToHDF5 attribute) (dasf.transforms.ArrayToZarr attribute) (dasf.transforms.transforms.ArrayToHDF5 attribute) (dasf.transforms.transforms.ArrayToZarr attribute) (dasf.transforms.transforms.ZarrToArray attribute) (dasf.transforms.ZarrToArray attribute) Fit (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.base) fit() (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer method) (dasf.ml.dl.LightningTrainer method) (dasf.transforms.base.Fit method) (dasf.transforms.Fit method) (dasf.transforms.operations.Reshape method) (dasf.transforms.Reshape method) (in module dasf.ml.dl.pytorch_lightning) fit_from_model() (dasf.transforms.base.Fit static method) (dasf.transforms.Fit static method) fit_predict() (dasf.transforms.base.FitPredict method) (dasf.transforms.FitPredict method) fit_predict_from_model() (dasf.transforms.base.FitPredict static method) (dasf.transforms.FitPredict static method) fit_transform() (dasf.transforms.base.FitTransform method) (dasf.transforms.FitTransform method)

fit_transform_from_model() (dasf.transforms.base.FitTransform static method) (dasf.transforms.FitTransform static method) FitPredict (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.base) FitTransform (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.base) flatten (dasf.feature_extraction.ConcatenateToArray attribute) (dasf.feature_extraction.transforms.ConcatenateToArray attribute) FLOW_BEGIN (dasf.profile.profiler.EventPhases attribute) FLOW_END (dasf.profile.profiler.EventPhases attribute) FLOW_STEP (dasf.profile.profiler.EventPhases attribute) flush (dasf.profile.profiler.FileDatabase attribute) forward() (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet method) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip method) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet method) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip method) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet method) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip method) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet method) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip method) from_array() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetArray method) func_aggregate (dasf.transforms.base.ReductionTransform attribute) (dasf.transforms.ReductionTransform attribute) func_chunk (dasf.transforms.base.ReductionTransform attribute) (dasf.transforms.ReductionTransform attribute) func_combine (dasf.transforms.base.ReductionTransform attribute) (dasf.transforms.ReductionTransform attribute) function (dasf.transforms.base.MappedTransform attribute) (dasf.transforms.MappedTransform attribute)

G

g_data_attrs (in module dasf.utils.labels) g_func_attrs (in module dasf.utils.labels) g_hash_attrs (in module dasf.utils.labels) gamma (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) GaussianMixture (class in dasf.ml.mixture.gmm) gen_min_span_tree (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) get_attributes() (in module dasf.utils.labels) get_backend() (dasf.pipeline.executors.LocalExecutor method) (dasf.pipeline.executors.wrapper.LocalExecutor method) get_backend_supported() (in module dasf.utils.funcs) get_covariance() (dasf.ml.decomposition.PCA method) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA method) get_dask_gpu_count() (in module dasf.utils.funcs) get_dask_gpu_names() (in module dasf.utils.funcs) get_dask_mem_usage() (in module dasf.utils.funcs) get_dask_running_client() (in module dasf.utils.funcs) get_dataset() (dasf.pipeline.executors.base.Executor method) (dasf.pipeline.executors.dask.DaskPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.dask.DaskTasksPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.DaskPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.DaskTasksPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.Executor method)

get_gpu_count() (in module dasf.utils.funcs) get_gpu_from_workers() (in module dasf.utils.funcs) get_machine_memory_avail() (in module dasf.utils.funcs) get_params() (dasf.transforms.base.GetParams method) (dasf.transforms.GetParams method) get_precision() (dasf.ml.decomposition.PCA method) (dasf.ml.decomposition.pca.PCA method) get_result_from() (dasf.pipeline.Pipeline method) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline method) get_traces() (dasf.profile.profiler.EventDatabase method) (dasf.profile.profiler.EventProfiler method) (dasf.profile.profiler.FileDatabase method) get_uuid() (dasf.transforms.base.Operator method) get_worker_info() (in module dasf.utils.funcs) GetParams (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.base) GetSubCubeArray (class in dasf.feature_extraction.transforms) GetSubDataframe (class in dasf.feature_extraction) (class in dasf.feature_extraction.transforms) GLOBAL (dasf.profile.profiler.InstantEventScope attribute) global_rank() (dasf.ml.dl.clusters.dask.DaskClusterEnvironment method) (dasf.ml.dl.clusters.DaskClusterEnvironment method) gpu_num (dasf.profile.plugins.GPUAnnotationPlugin attribute) GPU_SUPPORTED (in module dasf.utils.funcs) GPUAnnotationPlugin (class in dasf.profile.plugins)

H

handle (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering attribute) has_dataset() (dasf.pipeline.executors.base.Executor method) (dasf.pipeline.executors.dask.DaskPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.dask.DaskTasksPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.DaskPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.DaskTasksPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.Executor method)

HDBSCAN (class in dasf.ml.cluster) (class in dasf.ml.cluster.hdbscan) Histogram (class in dasf.feature_extraction) (class in dasf.feature_extraction.histogram) hostname (dasf.profile.plugins.ResourceMonitor attribute) human_readable_size() (in module dasf.utils.funcs)

I

idx (dasf.ml.dl.models.devconvnet.MyAccuracy attribute) inference() (dasf.ml.inference.loader.base.BaseLoader method) (dasf.ml.inference.loader.torch.TorchLoader method) info (dasf.pipeline.executors.base.Executor property) (dasf.pipeline.executors.dask.DaskPipelineExecutor property) (dasf.pipeline.executors.DaskPipelineExecutor property) (dasf.pipeline.executors.Executor property) info() (dasf.pipeline.Pipeline method) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline method) init (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute) init_logging() (in module dasf.utils.logging) init_max_iter (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute) init_vgg16_params() (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet method) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip method) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet method) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip method) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet method) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip method) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet method) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip method) input_len (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) inside_with (in module dasf.utils.labels) INSTANT (dasf.profile.profiler.EventPhases attribute) InstantEvent (class in dasf.profile.profiler) InstantEventScope (class in dasf.profile.profiler) is_array() (in module dasf.utils.types) is_connected (dasf.pipeline.executors.base.Executor property) (dasf.pipeline.executors.dask.DaskPipelineExecutor property) (dasf.pipeline.executors.DaskPipelineExecutor property) (dasf.pipeline.executors.Executor property) (dasf.pipeline.executors.LocalExecutor property) (dasf.pipeline.executors.ray.RayPipelineExecutor property) (dasf.pipeline.executors.wrapper.LocalExecutor property)

is_cpu_array() (in module dasf.utils.types) is_cpu_dataframe() (in module dasf.utils.types) is_cpu_datatype() (in module dasf.utils.types) is_dask() (in module dasf.utils.types) is_dask_array() (in module dasf.utils.types) is_dask_cpu_array() (in module dasf.utils.types) is_dask_cpu_dataframe() (in module dasf.utils.types) is_dask_dataframe() (in module dasf.utils.types) is_dask_gpu_array() (in module dasf.utils.types) is_dask_gpu_dataframe() (in module dasf.utils.types) is_dask_gpu_supported() (in module dasf.utils.funcs) is_dask_local_supported() (in module dasf.utils.funcs) is_dask_supported() (in module dasf.utils.funcs) is_dataframe() (in module dasf.utils.types) is_executor_cluster() (in module dasf.utils.funcs) is_executor_cpu() (in module dasf.utils.funcs) is_executor_gpu() (in module dasf.utils.funcs) is_executor_single() (in module dasf.utils.funcs) is_forced_gpu() (in module dasf.utils.decorators) is_forced_local() (in module dasf.utils.decorators) is_gds_supported() (in module dasf.utils.funcs) is_gpu_array() (in module dasf.utils.types) is_gpu_dataframe() (in module dasf.utils.types) is_gpu_datatype() (in module dasf.utils.types) is_gpu_supported() (in module dasf.utils.funcs) is_jax_supported() (in module dasf.utils.funcs) is_kvikio_compat_mode() (in module dasf.utils.funcs) is_kvikio_supported() (in module dasf.utils.funcs) is_notebook() (in module dasf.utils.funcs) is_nvcomp_codec_supported() (in module dasf.utils.funcs) is_xarray_array() (in module dasf.utils.types)

J

JAX_SUPPORTED (in module dasf.utils.funcs)

K

kernel_params (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) KMeans (class in dasf.ml.cluster) (class in dasf.ml.cluster.kmeans)

kmeans_params (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) KVIKIO_SUPPORTED (in module dasf.utils.funcs)

L

LazyDatasetComputer (class in dasf.ml.dl.lightning_fit) leaf_size (dasf.ml.cluster.DBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.dbscan.DBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) learned_billinear (dasf.ml.dl.models.devconvnet.NNModule attribute) learning_rate (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) learning_rateN (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) LightningTrainer (class in dasf.ml.dl) (class in dasf.ml.dl.lightning_fit) limit_train_batches (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer attribute) (dasf.ml.dl.LightningTrainer attribute) limit_val_batches (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer attribute) (dasf.ml.dl.LightningTrainer attribute) LinearSVC (class in dasf.ml.svm) (class in dasf.ml.svm.svm) LinearSVR (class in dasf.ml.svm) (class in dasf.ml.svm.svm) linkage (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering attribute) load() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.base.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.base.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.base.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.base.DatasetXarray method) (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.DatasetXarray method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet method) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip method) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet method) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip method) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet method) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip method) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet method) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip method) (dasf.ml.inference.loader.base.BaseLoader method)

load_model() (dasf.ml.inference.loader.base.BaseLoader method) (dasf.ml.inference.loader.torch.TorchLoader method) load_model_distributed() (dasf.ml.inference.loader.base.BaseLoader method) local (dasf.pipeline.executors.dask.DaskPipelineExecutor attribute) (dasf.pipeline.executors.DaskPipelineExecutor attribute) local_rank() (dasf.ml.dl.clusters.dask.DaskClusterEnvironment method) (dasf.ml.dl.clusters.DaskClusterEnvironment method) LocalExecutor (class in dasf.pipeline.executors) (class in dasf.pipeline.executors.wrapper) lock_timeout (dasf.profile.profiler.FileDatabase attribute)

M

main() (in module dasf.profile.analysis) main_address (dasf.ml.dl.clusters.dask.DaskClusterEnvironment property) (dasf.ml.dl.clusters.DaskClusterEnvironment property) main_port (dasf.ml.dl.clusters.dask.DaskClusterEnvironment property) (dasf.ml.dl.clusters.DaskClusterEnvironment property) make_blobs (class in dasf.datasets) (class in dasf.datasets.datasets) make_classification (class in dasf.datasets) (class in dasf.datasets.datasets) make_regression (class in dasf.datasets.datasets) MappedTransform (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.base) MARK (dasf.profile.profiler.EventPhases attribute) marks (dasf.profile.plugins.GPUAnnotationPlugin attribute) match_reference_implementation (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) max_epochs (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer attribute) (dasf.ml.dl.LightningTrainer attribute) max_iter (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute) max_samples_per_batch (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute) memory (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering attribute) MemoryBenchmark (class in dasf.utils.benchmark) METADATA (dasf.profile.profiler.EventPhases attribute) metadata() (dasf.datasets.base.DatasetArray method) (dasf.datasets.base.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.base.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.base.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.base.DatasetXarray method) (dasf.datasets.base.DatasetZarr method) (dasf.datasets.DatasetArray method) (dasf.datasets.DatasetDataFrame method) (dasf.datasets.DatasetHDF5 method) (dasf.datasets.DatasetLabeled method) (dasf.datasets.DatasetXarray method) (dasf.datasets.DatasetZarr method) metric (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.DBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.dbscan.DBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) min_cluster_size (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) MIN_CUR (dasf.utils.funcs.NotebookProgressBar attribute) min_samples (dasf.ml.cluster.DBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.dbscan.DBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) MIN_TOTAL (dasf.utils.funcs.NotebookProgressBar attribute) MixtureClassifier (class in dasf.ml.mixture.classifier) model (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer attribute) (dasf.ml.dl.LightningTrainer attribute) model_class_or_file (dasf.ml.inference.loader.torch.TorchLoader attribute) model_instances (dasf.ml.inference.loader.base.BaseLoader attribute) module dasf dasf.datasets dasf.datasets.base dasf.datasets.datasets dasf.datasets.download dasf.debug dasf.debug.debug dasf.feature_extraction dasf.feature_extraction.histogram dasf.feature_extraction.transforms dasf.ml dasf.ml.cluster dasf.ml.cluster.agglomerative dasf.ml.cluster.classifier dasf.ml.cluster.dbscan dasf.ml.cluster.hdbscan dasf.ml.cluster.kmeans dasf.ml.cluster.som dasf.ml.cluster.spectral dasf.ml.decomposition dasf.ml.decomposition.pca dasf.ml.dl dasf.ml.dl.clusters dasf.ml.dl.clusters.dask dasf.ml.dl.lightning_fit dasf.ml.dl.models dasf.ml.dl.models.devconvnet dasf.ml.dl.pytorch_lightning dasf.ml.inference dasf.ml.inference.loader dasf.ml.inference.loader.base dasf.ml.inference.loader.torch dasf.ml.mixture.classifier dasf.ml.mixture.gmm dasf.ml.model_selection dasf.ml.model_selection.split dasf.ml.neighbors dasf.ml.neighbors.neighbors dasf.ml.preprocessing dasf.ml.preprocessing.standardscaler dasf.ml.svm dasf.ml.svm.svm dasf.ml.xgboost dasf.ml.xgboost.xgboost dasf.pipeline dasf.pipeline.executors dasf.pipeline.executors.base dasf.pipeline.executors.dask dasf.pipeline.executors.ray dasf.pipeline.executors.wrapper dasf.pipeline.pipeline dasf.pipeline.types dasf.profile dasf.profile.analysis dasf.profile.plugins dasf.profile.profiler dasf.profile.utils dasf.transforms dasf.transforms.base dasf.transforms.memory dasf.transforms.operations dasf.transforms.transforms dasf.utils dasf.utils.benchmark dasf.utils.decorators dasf.utils.funcs dasf.utils.labels dasf.utils.logging dasf.utils.types

monitor (dasf.profile.plugins.ResourceMonitor attribute) multi_cpu (dasf.pipeline.types.TaskExecutorType attribute) multi_gpu (dasf.pipeline.types.TaskExecutorType attribute) MultiEventDatabase (class in dasf.profile) (class in dasf.profile.utils) MyAccuracy (class in dasf.ml.dl.models.devconvnet)

N

n_classes (dasf.ml.dl.models.devconvnet.NNModule attribute) n_clusters (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) n_components (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) n_init (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) n_jobs (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) n_neighbors (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) n_parallel (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) name (dasf.profile.plugins.GPUAnnotationPlugin attribute) (dasf.profile.plugins.ResourceMonitor attribute) (dasf.profile.plugins.WorkerTaskPlugin attribute) (dasf.profile.profiler.CompleteEvent attribute) (dasf.profile.profiler.DurationBeginEvent attribute) (dasf.profile.profiler.DurationEndEvent attribute) (dasf.profile.profiler.InstantEvent attribute)

NearestNeighbors (class in dasf.ml.neighbors) (class in dasf.ml.neighbors.neighbors) neighborhood_function (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) NeuralNetClassifier (class in dasf.ml.dl) (class in dasf.ml.dl.pytorch_lightning) new_axis (dasf.transforms.base.MappedTransform attribute) (dasf.transforms.MappedTransform attribute) ngpus (dasf.pipeline.executors.dask.DaskPipelineExecutor property) (dasf.pipeline.executors.DaskPipelineExecutor property) (dasf.pipeline.executors.LocalExecutor property) (dasf.pipeline.executors.ray.RayPipelineExecutor property) (dasf.pipeline.executors.wrapper.LocalExecutor property) NNModule (class in dasf.ml.dl.models.devconvnet) node_rank() (dasf.ml.dl.clusters.dask.DaskClusterEnvironment method) (dasf.ml.dl.clusters.DaskClusterEnvironment method) Normalize (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.transforms) NotebookProgressBar (class in dasf.utils.funcs) num_epochs (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) num_nodes (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer attribute) (dasf.ml.dl.LightningTrainer attribute) NV_COMP_BATCH_CODEC_SUPPORTED (in module dasf.utils.funcs)

O

OBJECT_CREATED (dasf.profile.profiler.EventPhases attribute) OBJECT_DESTROYED (dasf.profile.profiler.EventPhases attribute) OBJECT_SNAPSHOT (dasf.profile.profiler.EventPhases attribute) on_pipeline_end() (dasf.pipeline.pipeline.PipelinePlugin method) (dasf.pipeline.PipelinePlugin method) on_pipeline_start() (dasf.pipeline.pipeline.PipelinePlugin method) (dasf.pipeline.PipelinePlugin method) on_task_end() (dasf.pipeline.pipeline.PipelinePlugin method) (dasf.pipeline.PipelinePlugin method) on_task_error() (dasf.pipeline.pipeline.PipelinePlugin method) (dasf.pipeline.PipelinePlugin method) on_task_start() (dasf.pipeline.pipeline.PipelinePlugin method) (dasf.pipeline.PipelinePlugin method) open() (dasf.profile.profiler.EventDatabase method) Operator (class in dasf.transforms.base) output (dasf.ml.model_selection.split.train_test_split attribute)

output_chunk (dasf.transforms.base.MappedTransform attribute) (dasf.transforms.MappedTransform attribute) output_file (dasf.profile.profiler.EventProfiler attribute) output_size (dasf.transforms.base.ReductionTransform attribute) (dasf.transforms.ReductionTransform attribute) output_type (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.DBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.dbscan.DBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute) overlap (dasf.transforms.operations.ApplyPatchesBase attribute) oversampling_factor (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute)

P

p (dasf.ml.cluster.DBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.dbscan.DBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) (dasf.transforms.operations.SliceArrayByPercentile attribute) parser (in module dasf.profile.analysis) PCA (class in dasf.ml.decomposition) (class in dasf.ml.decomposition.pca) per_function_bottleneck() (dasf.profile.analysis.TraceAnalyser method) (dasf.profile.TraceAnalyser method) per_task_bottleneck() (dasf.profile.analysis.TraceAnalyser method) (dasf.profile.TraceAnalyser method) per_worker_task_balance() (dasf.profile.analysis.TraceAnalyser method) (dasf.profile.TraceAnalyser method) percentage (dasf.utils.funcs.NotebookProgressBar attribute) persist_embedding (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) PersistDaskData (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.memory) phase (dasf.profile.profiler.CompleteEvent attribute) (dasf.profile.profiler.DurationBeginEvent attribute) (dasf.profile.profiler.DurationEndEvent attribute) (dasf.profile.profiler.InstantEvent attribute) Pipeline (class in dasf.pipeline) (class in dasf.pipeline.pipeline) PipelinePlugin (class in dasf.pipeline) (class in dasf.pipeline.pipeline) port (dasf.pipeline.executors.dask.DaskPipelineExecutor attribute) (dasf.pipeline.executors.DaskPipelineExecutor attribute) (dasf.pipeline.executors.ray.RayPipelineExecutor attribute) post_run() (dasf.pipeline.executors.base.Executor method) (dasf.pipeline.executors.dask.DaskTasksPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.DaskTasksPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.Executor method) (dasf.pipeline.executors.LocalExecutor method) (dasf.pipeline.executors.wrapper.LocalExecutor method)

postprocessing() (dasf.ml.inference.loader.base.BaseLoader method) pre_run() (dasf.pipeline.executors.base.Executor method) (dasf.pipeline.executors.dask.DaskTasksPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.DaskTasksPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.Executor method) (dasf.pipeline.executors.LocalExecutor method) (dasf.pipeline.executors.wrapper.LocalExecutor method) precompute_distances (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute) Predict (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.base) predict() (dasf.ml.inference.loader.base.BaseLoader method) (dasf.transforms.base.Predict method) (dasf.transforms.Predict method) predict2() (dasf.ml.cluster.KMeans method) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans method) predict_from_model() (dasf.transforms.base.Predict static method) (dasf.transforms.Predict static method) prediction_data (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) prepare_data() (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.TorchDataLoader method) preprocessing() (dasf.ml.inference.loader.base.BaseLoader method) PROCESS (dasf.profile.profiler.InstantEventScope attribute) process_id (dasf.profile.profiler.CompleteEvent attribute) (dasf.profile.profiler.DurationBeginEvent attribute) (dasf.profile.profiler.DurationEndEvent attribute) (dasf.profile.profiler.InstantEvent attribute)

Q

quantization_error() (dasf.ml.cluster.SOM method) (dasf.ml.cluster.som.SOM method)

queue (dasf.profile.profiler.FileDatabase attribute)

R

random_seed (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) random_state (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.model_selection.split.train_test_split attribute) RayPipelineExecutor (class in dasf.pipeline.executors.ray) record() (dasf.profile.profiler.EventDatabase method) (dasf.profile.profiler.FileDatabase method) record_complete_event() (dasf.profile.profiler.EventProfiler method) record_duration_begin_event() (dasf.profile.profiler.EventProfiler method) record_duration_end_event() (dasf.profile.profiler.EventProfiler method) record_instant_event() (dasf.profile.profiler.EventProfiler method) ReductionTransform (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.base) register_dataset() (dasf.pipeline.executors.base.Executor method) (dasf.pipeline.executors.dask.DaskPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.dask.DaskTasksPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.DaskPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.DaskTasksPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.Executor method)

register_default_profiler() (in module dasf.profile) (in module dasf.profile.utils) register_plugin() (dasf.pipeline.executors.base.Executor method) (dasf.pipeline.executors.dask.DaskPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.DaskPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.Executor method) (dasf.pipeline.Pipeline method) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline method) Reshape (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.operations) ResourceMonitor (class in dasf.profile.plugins) run() (dasf.pipeline.Pipeline method) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline method) (dasf.utils.benchmark.MemoryBenchmark method) (dasf.utils.benchmark.TimeBenchmark method) (dasf.utils.funcs.NotebookProgressBar method) run_dask_clustered() (in module dasf.ml.dl.pytorch_lightning)

S

SampleDataframe (class in dasf.feature_extraction) (class in dasf.feature_extraction.transforms) save (dasf.transforms.ArrayToHDF5 attribute) (dasf.transforms.ArrayToZarr attribute) (dasf.transforms.transforms.ArrayToHDF5 attribute) (dasf.transforms.transforms.ArrayToZarr attribute) (dasf.transforms.transforms.ZarrToArray attribute) (dasf.transforms.ZarrToArray attribute) scope (dasf.profile.profiler.InstantEvent attribute) seg_score19 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) set_current() (dasf.utils.funcs.NotebookProgressBar method) set_error() (dasf.utils.funcs.NotebookProgressBar method) set_executor_cpu() (in module dasf.utils.funcs) set_executor_default() (in module dasf.utils.funcs) set_executor_gpu() (in module dasf.utils.funcs) set_executor_multi_cpu() (in module dasf.utils.funcs) set_executor_multi_gpu() (in module dasf.utils.funcs) set_global_rank() (dasf.ml.dl.clusters.dask.DaskClusterEnvironment method) (dasf.ml.dl.clusters.DaskClusterEnvironment method) set_idx() (dasf.ml.dl.models.devconvnet.MyAccuracy method) set_params() (dasf.transforms.base.SetParams method) set_world_size() (dasf.ml.dl.clusters.dask.DaskClusterEnvironment method) (dasf.ml.dl.clusters.DaskClusterEnvironment method) SetParams (class in dasf.transforms.base) setup() (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.TorchDataLoader method) (dasf.profile.plugins.GPUAnnotationPlugin method) (dasf.profile.plugins.WorkerTaskPlugin method) setup_dask_protocol() (in module dasf.pipeline.executors.dask) shape (dasf.datasets.base.DatasetArray property) (dasf.datasets.base.DatasetDataFrame property) (dasf.datasets.base.DatasetZarr property) (dasf.datasets.DatasetArray property) (dasf.datasets.DatasetDataFrame property) (dasf.datasets.DatasetZarr property) (dasf.transforms.operations.Reshape attribute) (dasf.transforms.Reshape attribute)

show() (dasf.utils.funcs.NotebookProgressBar method) shuffle (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer attribute) (dasf.ml.dl.LightningTrainer attribute) (dasf.ml.model_selection.split.train_test_split attribute) shutdown() (dasf.pipeline.executors.base.Executor method) (dasf.pipeline.executors.dask.DaskPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.dask.DaskTasksPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.DaskPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.DaskTasksPipelineExecutor method) (dasf.pipeline.executors.Executor method) sigma (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) sigmaN (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) single_cpu (dasf.pipeline.types.TaskExecutorType attribute) single_gpu (dasf.pipeline.types.TaskExecutorType attribute) SliceArray (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.operations) SliceArrayByPercent (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.operations) SliceArrayByPercentile (class in dasf.transforms.operations) SOM (class in dasf.ml.cluster) (class in dasf.ml.cluster.som) SpectralClustering (class in dasf.ml.cluster) (class in dasf.ml.cluster.spectral) StandardScaler (class in dasf.ml.preprocessing) (class in dasf.ml.preprocessing.standardscaler) start() (dasf.profile.plugins.ResourceMonitor method) (dasf.utils.labels.DaskLabel method) std_coeff (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) stop() (dasf.profile.plugins.ResourceMonitor method) (dasf.utils.labels.DaskLabel method) strategy (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer attribute) (dasf.ml.dl.LightningTrainer attribute) SVC (class in dasf.ml.svm) (class in dasf.ml.svm.svm) SVR (class in dasf.ml.svm) (class in dasf.ml.svm.svm) sync_future_loop() (in module dasf.utils.funcs)

T

TargeteredTransform (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.base) task_handler() (in module dasf.utils.decorators) TaskExecutorType (class in dasf.pipeline.types) test_dataloader() (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.TorchDataLoader method) test_size (dasf.ml.model_selection.split.train_test_split attribute) test_step() (dasf.ml.dl.models.devconvnet.NNModule method) THREAD (dasf.profile.profiler.InstantEventScope attribute) thread_id (dasf.profile.profiler.CompleteEvent attribute) (dasf.profile.profiler.DurationBeginEvent attribute) (dasf.profile.profiler.DurationEndEvent attribute) (dasf.profile.profiler.InstantEvent attribute) time (dasf.profile.plugins.ResourceMonitor attribute) TimeBenchmark (class in dasf.utils.benchmark) timestamp (dasf.profile.profiler.CompleteEvent attribute) (dasf.profile.profiler.DurationBeginEvent attribute) (dasf.profile.profiler.DurationEndEvent attribute) (dasf.profile.profiler.InstantEvent attribute) tol (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute) topology (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) TorchDataLoader (class in dasf.ml.dl.pytorch_lightning) TorchLoader (class in dasf.ml.inference.loader.torch) TorchPatchDeConvNet (class in dasf.ml.dl.models) (class in dasf.ml.dl.models.devconvnet) TorchPatchDeConvNetSkip (class in dasf.ml.dl.models) (class in dasf.ml.dl.models.devconvnet) TorchSectionDeConvNet (class in dasf.ml.dl.models) (class in dasf.ml.dl.models.devconvnet) TorchSectionDeConvNetSkip (class in dasf.ml.dl.models) (class in dasf.ml.dl.models.devconvnet) TraceAnalyser (class in dasf.profile) (class in dasf.profile.analysis)

traces_file_prefix (dasf.profile.profiler.EventProfiler attribute) train_dataloader() (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.TorchDataLoader method) train_size (dasf.ml.model_selection.split.train_test_split attribute) train_test_split (class in dasf.ml.model_selection.split) training_step() (dasf.ml.dl.models.devconvnet.NNModule method) Transform (class in dasf.transforms.base) transform() (dasf.feature_extraction.GetSubDataframe method) (dasf.feature_extraction.SampleDataframe method) (dasf.feature_extraction.transforms.GetSubCubeArray method) (dasf.feature_extraction.transforms.GetSubDataframe method) (dasf.feature_extraction.transforms.SampleDataframe method) (dasf.transforms.base.MappedTransform method) (dasf.transforms.base.ReductionTransform method) (dasf.transforms.base.Transform method) (dasf.transforms.ExtractData method) (dasf.transforms.MappedTransform method) (dasf.transforms.Normalize method) (dasf.transforms.operations.SliceArray method) (dasf.transforms.operations.SliceArrayByPercent method) (dasf.transforms.ReductionTransform method) (dasf.transforms.SliceArray method) (dasf.transforms.SliceArrayByPercent method) (dasf.transforms.transforms.ExtractData method) (dasf.transforms.transforms.Normalize method) (dasf.transforms.transforms.ZarrToArray method) (dasf.transforms.ZarrToArray method) transform_from_model() (dasf.transforms.base.Transform static method) transition() (dasf.profile.plugins.GPUAnnotationPlugin method) (dasf.profile.plugins.WorkerTaskPlugin method) trim (dasf.transforms.base.MappedTransform attribute) (dasf.transforms.MappedTransform attribute) trim_chunk_location() (in module dasf.utils.funcs)

U

unpool (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) unpool_block11 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) unpool_block13 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) unpool_block15 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute)

unpool_block17 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) unpool_block9 (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.devconvnet.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchPatchDeConvNetSkip attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNet attribute) (dasf.ml.dl.models.TorchSectionDeConvNetSkip attribute) unsqueeze_dim (dasf.ml.dl.lightning_fit.LazyDatasetComputer attribute) (dasf.ml.dl.lightning_fit.LightningTrainer attribute) (dasf.ml.dl.LightningTrainer attribute) update() (dasf.ml.dl.models.devconvnet.MyAccuracy method) (dasf.profile.plugins.ResourceMonitor method) USE_MEM_PROF (in module dasf.utils.benchmark) USE_MEMRAY (in module dasf.utils.benchmark) USE_RAY (in module dasf.pipeline.executors.ray)

V

val_dataloader() (dasf.ml.dl.pytorch_lightning.TorchDataLoader method) valid_analyses (in module dasf.profile.analysis) verbose (dasf.ml.cluster.agglomerative.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.AgglomerativeClustering attribute) (dasf.ml.cluster.DBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.dbscan.DBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.hdbscan.HDBSCAN attribute) (dasf.ml.cluster.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.kmeans.KMeans attribute) (dasf.ml.cluster.spectral.SpectralClustering attribute) (dasf.ml.cluster.SpectralClustering attribute)

visualize() (dasf.pipeline.Pipeline method) (dasf.pipeline.pipeline.Pipeline method) VisualizeDaskData (class in dasf.debug) (class in dasf.debug.debug)

W

weight_gaussian() (in module dasf.utils.funcs) weight_radial() (in module dasf.utils.funcs)

WorkerTaskPlugin (class in dasf.profile.plugins) world_size() (dasf.ml.dl.clusters.dask.DaskClusterEnvironment method) (dasf.ml.dl.clusters.DaskClusterEnvironment method)

X

x (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) (dasf.transforms.operations.SliceArray attribute) (dasf.transforms.operations.SliceArrayByPercent attribute) (dasf.transforms.SliceArray attribute) (dasf.transforms.SliceArrayByPercent attribute)

XDataArray (in module dasf.utils.types) XGBRegressor (class in dasf.ml.xgboost) (class in dasf.ml.xgboost.xgboost)

Y

y (dasf.ml.cluster.SOM attribute) (dasf.ml.cluster.som.SOM attribute) (dasf.transforms.operations.SliceArrayByPercent attribute) (dasf.transforms.SliceArrayByPercent attribute)

Z

z (dasf.transforms.operations.SliceArrayByPercent attribute) (dasf.transforms.SliceArrayByPercent attribute)

ZarrToArray (class in dasf.transforms) (class in dasf.transforms.transforms)